第二期移民：花蓮港廳官營移民時期 1909年（明治42年）至1917年（大正6年）
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面對第一期私營移民的失敗，日本基於考量（1）鞏固台灣的統治、（2）為日本往熱帶地區發展預做準備、（3）調節日本過剩人口及彌補日本農民土地過少的弊病、（4）國防與同化上的必要等因素下，殖產局局長宮尾舜治確立了移民事業改由國家直接經營，1909年（明治42年）以預算3萬圓進行官營移民事業，首先由殖產局林務課調查適合移民的地區，以及研究移民事項、農業經濟等問題。移民「適地」調查結果，總督府最後選定東部地區九處原野規劃設置移民村，並開始招募移民（注2）。
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吉野村與菸樓（注3）
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1909年（明治42年）起，殖產局林務課開始進行移民事業調查及準備工作，1910年（明治43年）總督佐久間左馬太裁決《移民實行案》，包括移民地、移民類別、設備、土木工程、土地整理、移民補助費和貸款、土地使用及所有權等，都有所規定。首先，移民種類方面，總督府分成「官營移民」和「個人自由移民」兩種，「官營移民」是由官方統籌募集和安排移代移民村；「個人自由移民」是指個別單獨赴台，自己從事開墾，且個人移民如果有意願，也可以安排收容於移民村中（注2）；官營移民資格方面，必須符合下列條件才能通過甄選（注2）：
移民提出申請書後，須透過戶籍地的警察調查審核後，申請書才會予以採納。為了鼓勵移民，總督府給予以下優惠條件（注1）：
1910年（明治43年）2月，總督府成立「花蓮港廳蓮鄉荳蘭移民指導所」，並從日本德島縣移入第一批農民（共9戶20人）於七腳川原野，此為官營移民之始，6月又移入52戶275人，七腳川原野成為台灣第一個官營移民村，共計61戶295人，1911年（明治44年）正式改名為「吉野村」；1913年（大正2年）設置「豐田村」；1914年（大正3年）設置「林田村」（注2）。
資料來源：轉引自《未竟的殖民：日本在台移民村》第94頁
吉野村街道（注3）
移民村內除了移民者的房子外，在村落的中心地區設置移民指導所、學校、醫院、傳教所、神社、灌溉排水溝渠、飲水設施、野獸防禦柵欄等公共設施，住宅與耕地之間以道路（有輕便道路和一般道路）聯絡，顯示總督府的規畫力求縝密（注2）。只不過，受制於颱風等自然災害的侵襲破壞、熱帶傳染病的威脅、野獸為害、官營移民與準備工作稍嫌倉促等等因素下，總督府在花蓮港廳經營移民事業，自1909年（明治42年）起至1917年（大正6年），前後只有9年，便將官營移民事業改以委託民間經營，官方則給予適當的協助，以助私營移民的推展（注2）。
參考資料：
1、行政院文化建設委員會（2003），《發現豐田：一個日本移民村的誕生與發展》。
2、賀田金三郎，維基百科網址：https://zh.wikipedia.org/wiki/%E8%B3%80%E7%94%B0%E9%87%91%E4%B8%89%E9%83%8E。
3、魚夫，花蓮開拓史的先驅：賀田組，網址：https://opinion.cw.com.tw/blog/profile/194/article/6305。
4、照片取自：驛傳社，網址http://www.ekidensha.com/news/data145.html。
5、照片取自：賀田村，維基百科網址：https://zh.wikipedia.org/wiki/%E8%B3%80%E7%94%B0%E6%9D%91。
6、張素玢，《未竟的殖民：日本在台移民村》，衛城出版社。
1、行政院文化建設委員會（2003），《發現豐田：一個日本移民村的誕生與發展》。
2、賀田金三郎，維基百科網址：https://zh.wikipedia.org/wiki/%E8%B3%80%E7%94%B0%E9%87%91%E4%B8%89%E9%83%8E。
3、魚夫，花蓮開拓史的先驅：賀田組，網址：https://opinion.cw.com.tw/blog/profile/194/article/6305。
4、照片取自：驛傳社，網址http://www.ekidensha.com/news/data145.html。
5、照片取自：賀田村，維基百科網址：https://zh.wikipedia.org/wiki/%E8%B3%80%E7%94%B0%E6%9D%91。
6、張素玢，《未竟的殖民：日本在台移民村》，衛城出版社。