環保團體和海洋科技博物館籌備處反對興建專用卸煤碼頭，台電說，電廠原址興建兩部80萬千瓦、總熱效率可達的44.5%的臨界燃煤發電機組，以及在瑞芳鎮的番仔澳西側海域興建專用卸煤碼頭，都已經通過環評，行政院並已列為重大建設計畫，而且台電委託專業學術單位及顧問公司進行研究評估，也證實不會影響海洋生態和地方觀光發展，台電只強調這是最可行的供煤方式。
但是地方上要求台電最好另外再找其他卸煤碼頭，台電表示，會再評估其他可能的替代方案，以及持續進行地方溝通，但目前初步認為無論在深澳灣的中油油港、或利用基隆港、蘇澳港、或台北港轉運卸煤，都需要付出更大的社會代價。
台電表示，目前只有執行舊有機組拆除。在還沒有取得地方民意支持之前，暫時都不會新建機組，或是進行碼頭有關的開發，而在今年度的工作預算計畫中，也沒有編列相關預算。
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