蕃茄內含有益於人體吸收的果糖、葡萄糖，多種礦物質和豐富的維他命，可蔬果兩用，生熟均可食。又維他命P的含量最豐富，含有機酸，帶酸味，台灣民間叫「甘仔密」、「臭柿子」。蕃茄中含有穩定的化學物質，雖經高熱烹調，做蕃茄汁、罐頭都不易破壞蕃茄紅素，價廉物美，取食容易。同時加工的蕃茄汁、醬，或不加鹽的罐頭，經測試，蕃茄紅素增3～4倍，紅透的蕃茄含量最多，是防癌抗癌聖品，生食時所含維他命C較豐。在100公克生蕃茄中，含蛋白質0.8公克、脂肪0.3公克、碳水化合物22公克（蘋果含量的一半），鈣8毫克、磷24毫克、鐵0.4毫克、鉀300毫克、胡蘿蔔素0.37毫克、維他命A 8毫克、維他命B1 0.94毫克、維他命B2 0.03毫克、維他命B6 0.6毫克，屬低熱量食物；含有硼、錳、銅微量元素，是人體需要的礦物質；食用纖維0.4，促進腸蠕動。；另含硒有多重防癌、抗癌效應。
蕃茄中含胡蘿蔔素量並不多，但其中所含的蕃茄紅素（是胡蘿蔔素的一種），具有多重生物效應，如有抗氧化、誘導癌細胞良性分化和凋謝，抑制癌細胞訊號傳遞作用及分裂等。內含的維他命A、B、C、E（果色愈紅含量愈多），與蕃茄紅素一起作用時，能抑制自由基對細胞染色體基因的損壞。1999年美國統計：多吃蕃茄的人，平均罹癌率可降低四成；據台大醫學院生化所研究，多吃蕃茄可以大幅減少攝護腺癌、胃癌、腸癌、卵巢癌、子宮頸癌、乳癌的發生率。蕃茄中含有葉酸，可抑制細胞訊號傳遞，而不易分裂繁殖。蕃茄纖維素含量中等，可促進腸蠕動；維他命A功效為抗皮膚老化及老人斑。
蕃茄含有榖胱甘肽，可維護細胞正常代謝，抑制酪氨酸梅的活性，可促進皮膚、內臟色素減退或消炎，預防老人斑及衰老、增強胃酸（胃酸過多者可少吃），及心臟血管疾病。糖尿病人若在飯前吃易感覺飽，能減少其他食物進食數量，一般飯時或飯後吃可助消化吸收。蕃茄內含有檸檬酸和蘋果酸，能分解體內脂肪以減肥。罹患口腔炎者，或口乾舌燥、黏膜病變等，吃一些蕃茄或蕃茄汁對黏膜組織有所幫助。因含酚酸（Phenalic Acids），中和亞硝酸鹽致癌物質，產生去除致癌因子或酸鹼平衡。服藥或藥物治療時，損耗體內維他命及礦物質，可藉此調節或補充，是老少咸宜的食物。老人宜少生食，以防腸蠕動慢不消化。
