承天宮為當時鄉長李龍洲先生所命名，李鄉長認為，鄭成功在台灣，曾設立『承天府』於台南行政中樞機構，因此將廟命名為『承天宮』。

永曆15年(1661年)4月1日，鄭成功統帥雄師，自鹿耳門登陸台灣，荷蘭人以為天降神兵，很快即攻克赤崁樓，驅逐荷蘭。爾後建設台灣，從事墾殖，寓兵於農，開府立縣，改台灣為東都，赤崁樓為「承天府」，將全台軍民百姓拓墾事項，全由承天府負責管理。（1661年－1683年）是台灣明鄭時期「東都明京」的行政單位，由南明延平王鄭成功打敗荷蘭東印度公司後所設立。承天府衙門置於赤崁樓，主官為承天府府尹。