沈葆楨因為牡丹社事件來台，清光緒元年（1875年）六月十八日，沈葆楨奏請 增設臺北一府三縣，終獲允准。 當臺北府城於光緒八年（1882年）動工後， 馬上在城內南門內建造文武廟，兩座廟皆朝南，文廟在左，武廟在右，即為臺北府的官建孔子廟(舊)(又稱文廟，亦稱聖廟)。 以前的孔廟均屬官建，禁止民間擅自興建，因此台北孔子廟(舊)初建時，是利用台北築城之剩餘款，由當時台灣兵備道夏獻綸與台北知府陳星聚督工，在光緒七年完成了大成殿、儀門與崇聖祠。第二年，再由台北仕紳提議募捐，再建造禮門、義路、檽星門、泮池與萬仞宮牆，到光緒十年（1884年）才竣工完成。 這座孔廟在劉銘傳任臺灣巡撫時，每年均如期舉行盛大祭典，是臺北讀書人 的盛事，到了光緒十七年（1891年）邵友濂繼任巡撫之後，派人到福建添購祭祀用器，且聘請禮官樂師來臺北教習。

       然而在光緒二十年（1894年）中日甲午戰爭，台灣割讓給日本。1895年6月日軍進駐台北孔子廟， 將文廟作為衛戊醫院，因而至聖先師及先賢牌位多被損毀，禮器與樂器亦遺失，建築物逐漸遭到荒廢，而祭孔典禮也停止。1899年在附近(即今日的中央氣象局)興建像墨水瓶的八角形台北測候所。並在日明治四十年（1907年）日人為建立國語學校，而拆除孔廟，並利用其址建造台北第一高等女學校（現今的北一女中 ）；當時國語學校是台灣最高學府，分為師範部、國語部(日語)、土語科(漢文)、電信科、農業科，後來另設中學部，女子部，附屬小學校，附屬公學校；中學部為第一中學，即現在的台北市立建國中學。 國語學校於1919年八月改稱台北師範學校。

        不久， 日人在國語學校內建一小閣，重彫至聖先師及諸賢之牌位奉祀，每年的孔子誕辰，開放閣樓供各界祭孔，讓學校師生致祭。  

        日人拆毀官建孔廟後，日大正六年（1917年）正月，台北瀛社同仁和大正學會會員，為了弘揚孔子教化提議恢復舉行釋奠典禮，組織崇聖會，每年農曆八月二十七日孔子誕辰，由日語學校恭迎牌位，在大稻埕公學校、蓬萊女子公學校或艋舺龍山寺、大龍峒保安宮等處輪流舉行祭典。

        民十四年(1925)一月初，地方仕紳群聚永樂町(今迪化街)一名中醫-葉鍊金 家中聚會，葉醫師深深認為台北市無孔廟很遺憾，在座詩人陳培根即稱：「如建於大龍峒，願捐獻私地」，當天就馬上決定重建孔廟。

        同年二月成立「台北聖廟建設籌備處」大家推舉辜顯榮為主理，李種玉、陳培根、黃純青、楊仲佐、鄭奎璧、陳天來、蔡彬淮、連雅堂等八位常務理事，三月，陳培根捐地二千餘坪，辜顯榮亦購田獻地一千餘坪，充為建廟基地。

        民十六年東西廡興工，十二月大成殿亦分別開工，由李種玉任工程總監督，黃贊鈞為助手，因李、黃兩位熱心負責，工程得以順利進行。 隔年四月上樑，儀門興工，十八年大成殿竣工。然而十九年年底因募捐 少、經費拮據，工程中輟達五年之久。民國二十四年始再復工，二十八年(1939年)工程照原設計完工，總面積五千二百坪。

        聘請泉州匠師王益順擔任興建臺北孔廟的總工程師，早先在大正九(1920)年時，受邀來台北修建艋舺龍山寺及新竹城隍廟。他的設計受大眾喜愛。所以大正十四(1925)年大龍峒孔廟的籌建，聘王益順為總工程師，繪圖設計，又請製圖師周財繪製圖面，共同擔任設計與建造的工作。王益順為泉州惠安縣的溪底村人，為清末福建最有名望的建築木匠，廈門的南普陀寺即由他修建。他將閩南式建築的許多精華，表現在台北孔廟之中。

      由大成殿、儀門及東西兩廡所共同團成的合院，是孔廟的核心部分，儀門是進大成殿的主門，平日關閉，只在祭孔當天打開。東西兩廡就像古代住宅的護室或廂房，內部神龕供奉孔子傑出的弟子及歷代弘揚儒學有貢獻先賢一百五十四位。大成殿內則供奉孔子的神位，是孔廟的主殿，殿內的樑柱上的斗栱，支撐中央的藻井及四周的天花板，所有的構造都以木榫結合，不用一根鐵釘。

      另外，在孔廟的建物中，有許多遵循古禮的代表物，譬如大成殿台基的階級，共有五級可上，這是代表尊貴的大殿才可用，大成殿月台前方嵌有御路，又稱為石陛，不能踐踏，萬仞宮牆代表孔子學問道德的高深，屋脊、樑柱等的交趾陶、蟠龍及七級寶塔等作品，都有可觀之處，值得細細品味。  

  吳瑞雲、謝慶沛《台北孔廟》，台北市大龍國小百週年校慶籌備會。

  吳瑞雲《大龍峒史蹟源流》，台北市大龍國小。

  李乾朗《台北市孔廟》，台北市孔廟管理委員會。

  李乾朗《傳統建築》，行政院新聞局。

  林瑛瑛 蔡明芬 陳世仁《自己蓋台北孔廟》，台北市孔廟管理委員會、遠流出版。

  葉倫會《台北孔廟文化之美》，葉倫會。

  台北市孔廟全球資訊網：http://www.ct.taipei.gov.tw/

  台北市大同區公所：http://www.dtdo.taipei.gov.tw/MP_124031.html

  台灣大百科全書：http://taiwanpedia.culture.tw/web/index