錫安堂雖由西方宣教士建立，在行政上卻是獨立的。台灣各地錫安堂成長至某一階段後，在行政經濟上也都是獨立的，惟彼此仍有美好的屬靈交通，彼此互相協助，互通有無。每年兩次的冬夏令會，全省各地信徒都會前來參加，各地傳道人每年也會聚集數次。各地錫安堂通常以其建立者為教會主要領袖，並逐漸興起一些核心同工配搭，使會務能和諧而有力地往前。通常教會中會依年齡或共同特點分成若干團契或小組，層層負責，分工牧養，好在人數增長時，不致失於鬆散。為著培育傳道人，以及差派他們往海內外各處宣教，或其他有助於上帝國度進展、有益於社會的事工，只要不影響各地教會的自主權，各地錫安堂可以有一些聯合事工。
目前教務概況 :全職傳道人有五十三位，全省共有廿六處錫安堂，各地信徒包括小孩，約近二千人，各地教會都正積極地傳福音，並預備拓植新的教會，甚至往海外差派宣教士，以各地方教會為單元，與台灣其他基督教宗派的教會，有愈來愈多的交流或互相邀請來分享上帝的啟示與恩典，或者一同參與聯合性的聚會，有時會從國外邀請信仰純正、有聖靈大能的講員來與台灣教會分享，有時本地同工也會前往海外帶領聚會。
資料來源 :
內政部民政司
教規組織 