在我國建築裝飾藝術中，木雕是歷史最悠久的一門工藝，木雕主要施工於門扇、花罩、薄子、斗拱、瓜筒、雀替…等位置，一般都不是承重的構材，鄉土藝術館的木雕也是依照這個原則施作於 「四架式卷棚式疊斗木構」、過廊的 「五架抬梁式木架 」，出檐和各屋宇的「桁」。特別是各屋的 「橢」、步道上的 「坐斗」、桃膽瓜柱下 「吊桶」、屋擔面的「雀替」。各房間 「門板」都頗為精美。台灣的木雕作品可分為閩南、廣東兩派。閩南派講究華麗流暢，廣東派講究濃密厚實，從鄉土藝術館內的木雕可充份體會閩南派的華麗流暢風味。

許多木雕建築廣泛採用大眾化的故事當題材，如三國演義、西遊記等，施刻於宅第、園林、祠堂、會館等地方，圖案花紋更趨向濃烈的自然風味，工藝的手法也更立體化，透雕、鏤雕等多層次的雕刻手法已成熟，鄉土藝術館內的木雕作品即是最具特色的代表作。鄉土藝術館的木雕主要施作的部份，為門屋前廊的四架式卷棚式疊斗木構、中庭左右過廊的五架式抬樑式木架、以及出檐和各屋宇桁，其中最精美的為門屋的疊斗木構。

鄉土藝術館內最常見的手法為浮雕與通雕或鏤空雕法，分述如下：

浮雕

浮雕多使用於門板或傢俱的構件上，在宅內的門窗，屏罩等則多用淺浮雕，適合近看。

通雕

而其他大型的木構件及屋架等較高處的地方則採用通雕較多，其中在格扇、門廳窗戶上都可看到這類作品，這種先在木料繪上紋圖案，再進行琢刻，透空的作品需要較高的工藝水平，作品看起來有立體層次。

鏤空雕

另外更高一級的鏤空雕，在宅內則運用在門廊的大型木構架上，所做出的作品全件通透，運用了複雜的工藝，可見當初鄉土藝術館的木雕師見有相當的水平。