台北市內湖區內溝溪位於台北盆地東側，地理位置為分布在五指山山脈的南麓，屬於基隆河北側流域的支流。以台灣的地質構造分區而言，五指山山脈屬於西部麓山帶的構造區，台灣島西側山脈與丘陵都屬於西部麓山帶，西部麓山帶是在台灣造山運動中較晚期（約3-4百萬年之後）才隆起產生的山脈。台灣造山運動（稱為蓬萊造山運動）的擠壓力量目前是逐漸由北向南遷移，主要分布在新竹以南區域，北部地區的台北、桃園以及宜蘭地區都已經脫離造山運動的作用。大約在1百萬年前的造山運動中，台灣東南朝向西北側的擠壓力量逐漸消失轉移，形成地殼出現拉開且下陷的現象，因而造成了台北盆地與蘭陽平原。由於北部地區的地殼逐漸沉降，因此區域內的山脈不再長高，河床也不再被隆起，並且有逐漸降低的趨勢，加上侵蝕作用促使河谷逐漸加寬，形成寬闊的U型谷，使得北部地區寬闊的河谷地形，與中南部地區狹窄深邃的V型河谷特徵有很大的差異，其中又以基隆河的河谷地形最具代表性。
西部麓山帶出露於地表的岩層，屬於較為年輕的沉積岩，五指山山脈的沉積岩年代則屬於漸新世至中新世（3千5百萬年~1千萬年），而內溝溪出露的岩層則屬於中新世的南港層，大約在1千7百萬年至1千3百萬年前。台灣島還沒有產生之前，濱海沙灘環境中便開始堆積出砂岩的地層，也就是內溝溪活動中心旁岩壁所出露的岩層，以及涼亭旁出現厚層、黃棕色的塊狀砂岩。
涼亭旁的砂岩表面並可見到層次變化豐富的紅色平行線紋，猶如大自然在岩石上劃了紅色彩繪，地質學家稱這種紅色彩繪的層層花紋為「銹染紋」。這些彩繪的紋路大都是出現在節理面必定有密切的關係。「銹染紋」成因是，當砂岩還埋藏在地底下時，由於含有大量氧化鐵（褐鐵礦）的地下水鹽著節理裂隙流動，紅色氧化鐵逐漸滲入並且沉澱在節理兩側砂岩中，因此節理兩側砂岩經常出現對稱的層層紅色線紋。氧化鐵就是一般所說的「鐵銹」，沉澱在岩石縫隙中，彷彿是岩石浸染了顏色，所以才會出現「銹染紋」如此詩意的名稱。
【以上資料由台灣地質科學系 陳文山教授提供 】