我們在選購時要先看外面的包裝的密封情況是否良好，依班都會以包裝袋緊貼著金針菇者較好。如果地頭容易脫落或根莖已呈現斷裂現象，或金針菇的菇體已軟化、褐變，都表示品質已經不佳，最好不要買。

金針菇為低鈉、高鉀的蔬菜類，因此洗腎及腎功能不好的人不宜多吃；此外，紅斑性狼瘡或關節炎患者也不宜多吃。就中醫的觀點，金針菇性冷，多吃可能會加重體質虛寒者的病情，包括脾胃虛寒、拉肚子的人都不宜多吃。

要特別注意的是，中國大陸的不肖金針菇罐頭業者為了保鮮，往往在生產過程中違法添加吊白塊 ( 漂白劑 ) 、工業鹽、工業硫磺和苯甲酸鈉等，嚴重為賀消費者健康，一定要注意其品質，以保安康。

如果是台灣正宗的金針菇，不但顏色雪白鮮嫩，而解保證沒有農藥和殺蟲劑，不但可以安心食用，即使生吃也沒有問題。台灣的雪白金針菇是研究者與菇農多年以來的心血結晶，國人應該珍惜並多加食用。