經由多次和環保專家的訪談和實地觀察，得知仙跡岩在環保團體定期的清理及越來越多的遊客皆能自重自愛，發揮公德心使然下，垃圾量已有逐年下降的傾向，這是個好現象，但是要達到環境清潔的標準，仍需持續努力。除了垃圾問題之外，仙跡岩還有其他的問題，諸如: 違章建築、 外來種動植物入侵、居民的濫種等，也不容忽視。略述於下：

搭建於半山腰的鐵皮屋及其他違建，不但破壞了環境美觀，也縮小動植物生存和活動的空間。

　因在仙跡岩失去天敵，所以繁殖速度快，影響原有的生態。

　仙跡岩的植物生態發展，有固定的環保團體負責維護，一般附近居民的隨意濫種，會破壞環保人員原先的規劃。

這些問題雖然還沒有解決，但所幸目前尚未帶給仙跡岩太大的傷害。如果能夠募集更多的資金和人員，提供環保團體用以改善維護仙跡岩的生態環境，加上公民道德教育的倡導實踐，期望仙跡岩能煥然一新，成為擁有最優質生態的台北綠地。